UGENE 1.11.4

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UGENE 1.11.4

一个复杂的基因组分析套件

UGENE是一个全面的基因组分析的套房设有多序列比对和复杂的的HMM建设者和搜索模块。

UGENE是一个方便的工具，还提供了一个可视化和交互的基因组浏览体验。

下面是一些主要特点“UGENE”：

·多序列比对使用肌肉和肌肉;
·HMM配置文件的神器出山:www.shenqi73.com建立和搜索，HMMER 2和3 HMMER的来源;
·PCR引物设计利用Primer 3;
·蛋白质二级结构预测使用GOR IV和PSIPRED的;
·搜索的限制性内切酶和整合REBASE;
·极快的重复取景器;
·搜索使用SITECON的转录因子结合位点;
·ORF取景器;
·完成Smith-Waterman算法实现。
·色谱可视化;
·3D查看器PDB及MMDB格式的文件;
·多序列比对编辑器;
·易于使用的工作流设计器自定义计算的工作流程。
·完整的现代多核处理器支持SSE指令;
·现代GPU（图形处理器）使用NVIDIA?（英伟达?）CUDA和ATI Stream的开箱即用的支持;
·Cell宽带引擎的集成解决方案;
·个人超级计算机和分布式计算解决方案。

此版本中的新功能：

·放大的最大命中数为远程BLAST结果
·基因组对准死锁
·删除PDB文件在调试模式下崩溃
·正确的物理内存大小为Win，Linux的信息
·基因组定位仪不工作，如果通过命令行运行（ugenecl）
·基因组定位器：“内存泄漏”的OpenCL模式
·基因组定位器：使用GPU优化“复选框启用，如果没有GPU能在设置
·基因组对准内存泄漏后，“建立索引”模式完成或取消
·基因组定位仪对准崩溃
·崩溃时参考序列的第一个大的一部分，包含N的基因组定位仪对准
·崩溃处理程序：发送报告胜利的x64信息
·基因组定位仪对准崩溃
·WD：复制元素后，拷贝参数不同
·崩溃，如果使用错误的蝴蝶结刀具路径，同时启动领结调整
·大会浏览器中显示的共识的问题
·的GFF文件是不正确的可视化
·Ugene T-咖啡对准开始崩溃
·去除序列比对编辑器的Ugene崩溃
·U. ..